全外显子与疾病
目前,全世界范围内已报道的单基因遗传病(或性状)超过12000种[1]。按照世界卫生组织的统计,大部分单基因病患病率为0.65%-1%,所有这些单基因病总发病率超过1%,全世界范围内单基因遗传病患者已达2000万人[2]。仅地中海贫血一项的重型和中间型患者就高达30万,“地贫”基因携带者更是高达3000万人[3]。
外显子组(exome)即一个个体的基因组DNA上所有蛋白质编码序列(即外显子,exon)的总和。人类外显子组序列仅占人类整个基因组序列的1%,约为30Mb,包括18万个左右的外显子,但其与多种疾病发生息息相关。据估计85%的人类致病突变都位于这1%的蛋白质编码序列上[4]。
对外显子组进行测序分析,可帮助我们有效阐明单基因疾病的遗传特征,深入探究疾病和遗传变异的内在关系,为携带者、患者家庭提供更多的科学指导。
覆盖范围:全基因组范围内20000个目标基因及侧翼序列100bp范围内的SNP和InDel(Insertion/Deletion)
检测技术:目标区域捕获技术+高通量测序技术
验证技术:Sanger测序
检测深度:平均测序深度超过200×
检测周期:30个工作日
先证者(Proband)模式:仅对先证者进行全外显子组遗传检测,通过Sanger测序验证其他家庭成员突变情况。
核心家系(Trios)模式:对先证者与其直系亲属进行全外显子组遗传检测,结合遗传方式分析确认新发突变、复合杂合突变,有效降低假阳性,提高诊断阳性率。
具有明确的遗传家族病史的患者;
具有非典型性疾病特征,或经过多种医学检测未查明分子致病原因的患者;
涉及某一或多个脏器异常,临床表型提示涉及单基因疾病的患者;
具有不明原因的发育迟缓、智力障碍、多神经发育异常、精神状态异常的患者。